Aj na území Slovenského krasu je dnes už nevyhnutná okamžitá eliminácia šírenia inváznych rastlín, ktoré svojim agresívnym obsadením priestoru už na mnohých hektároch ohrozujú pôvodné druhy resp. celé spoločenstvá. Tieto nepôvodné rastliny sú v mnohých prípadoch aj na miestach výskytu chránených rastlín, teda aj spôsob ochrany si vyžaduje individuálny prístup.

Program vypracovaný v rámci ochrany druhov v sebe zahrňuje sčasti elimináciu škôd na životnom prostredí v rámci spoločnej monitorovacej siete a spoločného postupu pri ničení inváznych rastlín na oboch stranách hraníc.

Dôležitou úlohou v rámci grantu bola likvidácia nepôvodných druhov, ktoré sa na niektorých miestach v lúčnych spoločenstvách, na poľnohospodárskych pôdach a v brehových porastov vyskytujú masovo. Jedná sa napr. o zlatobyľ kanadskú (Solidago canadensis) a zlatobyľ obrovskú (Solidago gigantea). Produkcia veľkého množstva semien umožňuje rastline kolonizovať otvorené, veľké priestory, na ktorých neskôr vytvára monokultúry v krajinnom priestore od Plešivca po hranicu s MR. Tak isto okolo obce Brzotín, Slavec,  a v Štítnickej doline.

V poslednom období sa rozšírila na vlhkých stanovištiach, pri potokoch a na ladom ležiacich pôdach slnečnica hľuznatá (Helianthus tuberosus). Na opustených a neobhospodarovaných plochách už úplne dominuje a agresívne kolonizuje čoraz väčšie plochy aj na území Slovenského krasu v údolí potoka Štítnik.

Obmedzenie resp. zastavenie šírenia bolo možné iba systematickou organizovanou prácou a to hlavne mechanickým ničením resp. lokálnymi postrekmi. Tieto práce sme vykonávali za účinnej pomoci externých spolupracovníkov.